上海宏基因組測序實驗
產品介紹
上海宏基因組測序實驗
一、服務介紹
宏基因組學研究不要求對每個微生物進行分離純化培養，而是直接從樣品中提取基因組DNA后進行測序分析。通過宏基因組測序，能夠解釋微生物群落多樣性、種群 結構、進化關系、功能活性及環境之間的相互協作關系，地擴展了微生物學研究范圍。環境微生物多樣性檢測是指通過對環境中微生物16S rDNA高變區/ITS 的PCR擴增產物進行高通量測序，分析該環境下微生物群落的多樣性和分布規律。
二、操作流程
1. 基因組DNA提取
2. DNA隨機打斷
3. 加測序街頭、構建文庫
4. 上機測序
5. 序列拼接
6. 生物信息學分析
三、生物信息分析
1. 物種鑒定
2. 多樣性統計學分析
3. 宏基因組拼接
4. 功能分析
5. 微生物群落結構及功能
四、 上海宏基因組測序實驗 樣品要求
1. 樣品類型：人體微生物的基因組DNA（雙鏈DNA序列）。
2. 樣品的量：構建小片段文庫，DNA樣品總量不低于5μg.
3. 樣品質量：OD260/280值應在1.8～2.0 之間；樣品的主帶應在23kb以上，基因組無降解。
4. 樣品濃度：樣品的濃度越高越好，低不應低于50ng/μl.
5. 送樣要求：寄送樣品好保持低溫環境，好的方法是凍干郵寄，其次是溶于TE，當然也可以溶于雙蒸水，樣品注明溶劑成分。
五、質量承諾
提供可靠數據和分析結果
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