上海miRNA測序實驗
產品介紹
上海miRNA測序實驗
miRNA 測序是研究特定組織在特定狀態下的已知miRNA，分析預測新的miRNA，并對已知 miRNA 和新miRNA進行靶基因預測。通過對miRNA靶基因注釋及代謝通路分析，將鑒定出的 miRNA與相應表型差異關聯起來，為研究miRNA對細胞進程的作用及其生物學影響提供了有力的工具。
上海miRNA測序實驗生物信息分析內容
1、數據產出統計和質量評估
2、sRNA在參考基因組上的分布
3、sRNA分類注釋統計
4、堿基偏好性分析
5、基因表達水平分析
6、新轉錄本預測
7、差異miRNA靶基因預測
8、差異基因篩選及聚類分析
9、差異表達miRNA靶基因GO富集分析
10、差異表達miRNA靶基因Pathway富集分析
11、差異表達miRNA靶基因蛋白互作網絡分析
技術參數
樣本類型：total RNA
樣本要求：總量≥3 μg，濃度≥200 ng/μL
文庫類型：Small RNA文庫
測序策略：HiSeq SE50，推薦數據量：≥10M reads
項目周期：35個工作日
結果示例
樣本已知miRNA各位置堿基偏好性
新miRNA二級結構及reads mapping示意圖
各個樣本之間共有novel miRNA分布
上一產品：上海細胞劃痕實驗.
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